Los protagonistas son dos adolescentes con vidas paralelas, aunque muy diferentes, que viven en un pueblo de Carolina del Norte. Los une un oscuro secreto: son hijos del mismo padre. Después de crecer en ambientes muy distintos, de repente, sus vidas se cruzan.

2x1 · El desesperado Reino del Amor

Lucas y Kieth se enteran de que Dan ha tenido un ataque al corazón y que sigue en el hospital por lo que deciden regresar a Tree Hill. Deb descubre que Haley y Nathan se han casado y se enfada. Mientras, Peyton y Brooke, que están molestas con Lucas por marcharse sin despedirse, tratan de salvar su amistad.

Temporada 2 · Episodio 1

2x2 · La verdad No hace Ruido

Deb está muy impresionada porque, tras sufrir el infarto, Dan parece otra persona. Al parecer, el 'efecto Fenix', frecuente en pacientes con problemas cardíacos, les hace sentirse introvertidos, arrepentidos y, a veces, alegres. Tambien Keith, en su visita al hospital, observa este comportamiento y se sorprende cuando Dan le pide que se haga cargo de su trabajo en el concesionario. Lucas les pide a Brooke y a Peyton que le ayudena a organizar una fiesta para los recién casados. Haley busca refugio en sus padres cuando Deb, nuevamente, le acusa de arruinar la vida de su hijo.

Temporada 2 · Episodio 2

2x3 · Cerca del Cielo Salvaje

Aunque ya esten casados, Tim insiste en hacer una despedida de solteros y Brooke se encargará de hacerle la suya a Haley. Lucas no sabe si visitar a Dan en el hospital o no. Karen vuelve al colegio. Keith le da trabajo a Dan.

Temporada 2 · Episodio 3

2x4 · No siempre se Consigue lo que se Quiere

La pandilla del Tree Hill tendrá que adaptarse al nuevo vecino llamado Felix. Felix salva a Brooke cuando lo atrapan robando en una tienda. Petyon pide consejo a Karen para organizar una noche 'para todos los públicos' con música en directo. Su idea es alabada por un productor. Lucas se ofrece para ayudar a su padre con la rehabilitación.

Temporada 2 · Episodio 4

2x5 · Me Atrevere

Félix organiza un juego de atrevimiento para ver hasta dónde llegan sus compañeros. Lucas conoce a una chica llamada Anna. Peyton acude a una Iglesia para confesarse por haber probado la cocaína. En la tienda donde trabaja Lucas entra una mujer y empieza a coquetear con él. Mientras, Karen sale con suprofesor Andy.

Temporada 2 · Episodio 5

2x6 · También Podríamos ser Extraños

La lluvia de meteoritos que está prevista para el fin de semana es aprovechada por todos para poder disfrutarla en la mejor compañía posible. De modo que Andy sorprende a Karen con una cena, Lucas invita a Anna a una cita en la cancha de baloncesto y Ketih cocinará para Jules en su primera cita. Brooke acepta una relación con Félix, y Peyton hace las primeras audiciones para cantar en el club. Dan decide mentir a Deb sobre los resultados de sus exámenes médicos para tratar de que pasen la noche juntos.

Temporada 2 · Episodio 6

2x7 · Que se desaten las fuerzas

Hoy se inagura el club de Karen y todos los de Tree Hill están ahí. lLucas y Felix se pelean por Anna. Chris iba a tocar pero en el último momento dice que no por lo que Haley se ve obligada a cantar para salvarle la noche a Peyton. Mouth intenta algo con Brooke cuando ella está bebida pero Felix se lleva todo el mérito. Kieth y Jules se dan cuenta de que su relación ha llegado a un nuevo nivel, mientras Dan le cunta deliberadamente a Karen que Deb se acostó con Keith.

Temporada 2 · Episodio 7

2x8 · Verdad, amarga verdad

Las chicas se van a dormir a casa de Haley y se desmadran. Lucas y Nathan van a Charlotte a una partido de baloncesto y para hacerse unas pruebas.

Temporada 2 · Episodio 8

2x9 · El truco consiste en seguir respirando

Lucas lleva a Anna al baile pero al final de la noche acaba con Brooke. Haley llega tarde y esto hace que Nathan se enfade, sobre todo porque se ha enterado de que pasa mucho tiempo con Chris. A Peyton se ve tentada a las drogas.

Temporada 2 · Episodio 9

2x10 · No me des por seguro

Nathan está preocupado por la salud de Lucas asique le cuenta a Karen que no se hizo las pruebas del corazón. Dan le ofrece a Keith el puesto de vicepresidente. Peyton deberá hacer frente a los rumores de que es lesbiana. Esto afecta a su amistad con Anna. Nathan y Haley empiezan a distanciarse.

Temporada 2 · Episodio 10

2x11 · El corazon siempre te hace volver

Haley se sorprende al ver a su hermana Taylor que está de visita pero no tanto como Nathan que la reconcoe del pasado. Brooke y felix deciden formalizar su relación y pasar a ser novios. Jake va a ver a Peyton y Anna le cuenta a Lucas un secreto.

Temporada 2 · Episodio 11

2x12 · Entre el orden y el azar

Nathan le cuenta la verdad a Haley sobre porque conoce a Taylor pero en cambio Haley no le dice que sigue mandándose emails con Chris. Lucas y Karen siguen peleados porque él sigue sin querer hacerse las pruebas. Keith le pide a Jules que se case con él. Mientras, Brooke lucha en su trabajo por conseguir una mejora de las condiciones laborales.

Temporada 2 · Episodio 12

2x13 · Muere el héroe

Cuando Michelle Branch y Jessica Harp de la banda 'The Wreckers' actuan en el club, Haley se da cuenta de que su verdadera vocación está en la música. Lucas decide vivir con Dan dejando espacio entre él y Karen y Nathan. Brooke se presenta a delegado pero se da cuenta de que quizás sea demasiado para ella. La relación entre Peyton y Jake se intensifica.

Temporada 2 · Episodio 13

2x14 · Las cosas que nadie sabrá nunca

Nathan está deseperado por como va su matrimonio con Haley por lo que tiene una crisis emocional y vuelve a ser el Nathan de antes. Karen sigue intentando averiguar que es lo que pudo causar que Lucas se fuera a casa de Dan. La relación entre Peyton y Jake se intensifica.

Temporada 2 · Episodio 14

2x15 · Una carta cerrada al mundo

El instituto Tree Hill hace un trabajo de regreso al pasado y ahí muchos confiesan secretos a una cámara.Nathan sigue enfadao porque Haley no aparece. Nathan y Lucas acaban en el calabozo. Felix le prepara una fiesta a Brooke para clebrar que es delegada de curso. Lucas decide vivir con Dan y Deb en vez de con Karen.

Temporada 2 · Episodio 15

2x16 · En algun lugar un reloj sigue corriendo

La boda de Keith y Jules ha revolucionado al pueblo entero. Brooke le pide a Lucas que sea su acompañante para el día del enlace. Nathan toma una importante decisión referente a su matrimonio. Jake y Peyton dan un gran paso en su relación. Karen y Andy descubre la relación secreta que mantienen Jules y Dan.

Temporada 2 · Episodio 16

2x17 · Algo que nunca tendré

Kieth se pone violento con Dan tras saber que él pagó a Jules para que se enamorase de él.Anna reconoce ante las autoridades escolares que Felix fue quien cometíó los actos vandálicos en la taquilla de Peyton. Lucas y Brooke discuten sobre la posible mudanza de ésta. Nathan intenta que Haley y él se vayan juntos a casa.

Temporada 2 · Episodio 17